Für die Oniumreaktion ist die Reaktion [A-B-C-D]:
A+-B-D-C A+-C + B=D
wobei zwischen B und D statt der Bindung auch eine längere Kette sein kann.
Für die Carbonyleliminierung ist die Reaktion [A-B-C]:
Für die McLafferty-Spaltung ist die Reaktion [A-B-C-D-E-F]:
Unter den Strukturen sind die von FRANZ bestimmte Reaktionswahrscheinlichkeit sowie die Äquivalenzklassen der Reaktion angegeben. Die Datenbanken, in die FRANZ diese Reaktionen schreibt, sind wegen der Größe der Dateien auf eine bestimmte Anzahl von Reaktionen beschränkt. FRANZ versucht mit der reduzierten Anzahl von Reaktionen dennoch den gesamten Datenraum abzudecken. Dazu teilt FRANZ, abhängig von der topologischen Beschaffenheit des Reaktionszentrums und der ersten und zweiten Sphäre von Atomen, die Reaktionen in mehrere Äquivalenzklassen ein. Diese sind hinter EQC: angegeben. FRANZ sammelt nach Möglichkeit gleich viele Reaktionen in den verschiedenen Äquivalenzklassen. Ist ein gewisser geduldeter Überhang an Reaktionen in einer Klasse überschritten, werden in diese Klasse keine neuen Reaktionen mehr aufgenommen, bis der Überhang durch den Eintrag von Reaktionen in andere Klassen wieder unter den Schwellwert sinkt.